Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECH1Q13011 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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