Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXD4Q12950 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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