Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms