Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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