Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STX4Q12846 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STX4Q12846 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms