Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4CQ08493 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms