Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL9Q07325 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCL9Q07325 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms