Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LTBQ06643 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LTBQ06643 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LTBQ06643 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms