Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTDSPL2Q05D32 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms