Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CREMQ03060 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREMQ03060 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms