Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC6A3Q01959 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC6A3Q01959 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms