Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms