Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SKOR1P84550 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SKOR1P84550 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms