Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SIM1P81133 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SIM1P81133 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIM1P81133 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIM1P81133 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIM1P81133 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms