Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLDN10P78369 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN10P78369 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms