Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NOMO3P69849 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOMO3P69849 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms