Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms