Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GFRA1P56159 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GFRA1P56159 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms