Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52P55327 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52P55327 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52P55327 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52P55327 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPD52P55327 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPD52P55327 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TPD52P55327 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TPD52P55327 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TPD52P55327 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms