Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRPF1P55201 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRPF1P55201 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms