Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELLP55199 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELLP55199 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELLP55199 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELLP55199 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELLP55199 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELLP55199 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELLP55199 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELLP55199 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELLP55199 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms