Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AP2S1P53680 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms