Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAB5CP51148 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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RAB5CP51148 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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RAB5CP51148 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAB5CP51148 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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