Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCT4P50991 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCT4P50991 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCT4P50991 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCT4P50991 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCT4P50991 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCT4P50991 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms