Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms