Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRA4P48169 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms