Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACADSBP45954 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACADSBP45954 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms