Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA4P43694 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA4P43694 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms