Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIK3CBP42338 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms