Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms