Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms