Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms