Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRABP1P29762 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms