Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL4A5P29400 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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