Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PEX2P28328 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX2P28328 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX2P28328 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX2P28328 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PEX2P28328 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PEX2P28328 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms