Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CADP27708 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CADP27708 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CADP27708 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CADP27708 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CADP27708 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CADP27708 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADP27708 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms