Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PLNP26678 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PLNP26678 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLNP26678 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLNP26678 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms