Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms