Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD247P20963 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CD247P20963 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CD247P20963 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD247P20963 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD247P20963 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CD247P20963 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms