Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRHP20396 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRHP20396 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRHP20396 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRHP20396 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRHP20396 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRHP20396 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRHP20396 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRHP20396 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms