Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT4P19013 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT4P19013 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT4P19013 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT4P19013 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT4P19013 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRT4P19013 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT4P19013 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KRT4P19013 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KRT4P19013 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRT4P19013 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms