Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXB4P17483 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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