Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB4P16144 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB4P16144 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms