Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2F2P13984 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF2F2P13984 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms