Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GP1BBP13224 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms