Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RARBP10826 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RARBP10826 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RARBP10826 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RARBP10826 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RARBP10826 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RARBP10826 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms