Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL3P10147 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL3P10147 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms