Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CSB-PGBD3P0DP91 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CSB-PGBD3P0DP91 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms