Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAPPC2BP0DI82 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms