Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C4BP0C0L5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C4BP0C0L5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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